菌肥是指含有特定微生物活體的制品，應用于農業生產，通過其中所含微生物的生命活動，增加植物養分的供應量或促進植物生長，提高產量，改善農產品品質及農業生態環境。它具有制造和協助作物吸收營養、增進土壤肥力、增強植物抗病和抗干旱能力，降低植物病蟲害、產生多種生理活性物質刺激和調控作物生長、減少化肥使用、促進農作物廢棄物、城市垃圾的腐熟和開發利用、土壤環境的凈化和修復作用、保護環境，以及提高農作物產品品質和食品安全等多方面的功效，在可持續農業戰略發展及在農牧業中的地位日趨重要。
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